Ο Ιωάννης Χατζημπούγιας γεννήθηκε στην Κοζάνη το 1942. Αποφοίτησε από το Γυμνάσιο το 1960. Από το 1961-1963 έλαβε μέρος σε υποτροφία του Θεαγενείου Αντικαρκινικού Ινστιτούτου Θες/νίκης, παίρνοντας το δίπλωμα του Τεχνικού Ιατρικού Βοηθού. Το 1969 πήρε το πτυχίο της Ιατρικής. Από το 1970 έως το 1972 υπηρέτησε ως ανθυπίατρος στον Ελληνικό Στρατό. Το 1972-1973 εκπλήρωσε την υποχρέωση της υπηρεσίας υπαίθρου. Από το 1973-1976 έλαβε από το Εργαστήριο Παθολογικής Ανατομικής του Α.Π.Θ. την ειδικότητα του Παθολογοανατόμου και ένα χρόνο μετά την ειδικότητα του Κυτταρολόγου. Το 1977 αναγορεύθηκε με άριστα, διδάκτωρ της Ιατρικής Σχολής του Α.Π.Θ. Από το 1977 έως το 1979 μετεκπαιδεύθηκε στην τότε Δυτική Γερμανία στο Essen ως Oberarzt.

Συνέγραψε πληθώρα εργασιών και δημοσιεύσεων στην ελληνική και διεθνή βιβλιογραφία. Έλαβε μέρος σε πληθώρα σεμιναρίων, διαλέξεων ανακοινώσεων στην ημεδαπή και αλλοδαπή. Το 1985 εκλέχτηκε τακτικός Καθηγητής Ανατομικής στο Αλεξάνδρειο Τεχνολογικό Ίδρυμα Θεσσαλονίκης.
Διετέλεσε επί σειρά ετών Προϊστάμενος του Τμήματος Μαιευτικής του ως άνω Ιδρύματος.
Συνέγραψε το βιβλίο «Στοιχεία Ανατομικής του Ανθρώπου» για τους φοιτητές και φοιτήτριες του ΤΕΙ.
Το 2009 ψηφίστηκε ομόφωνα ως ομότιμος Καθηγητής.